Le Brésil est le deuxième pays du monde le plus affecté par la lèpre. Depuis 1984, l'Ordre de Malte conduit un programme dans le Piaui, un des vastes Etats du Nord-est, dont la population n'est que de trois millions d'habitants. Dans cette région, la lèpre est encore hautement endémique, avec un taux de dépistage pouvant atteindre environ 6 pour 10 000. Le CIOMAL contribue au programme de l'Ordre de Malte depuis 1999. Centré sur la seule région de Picós (42 municipalités) ce programme touche près de 300 000 personnes, soit environ 10 % de la population du Piaui. En coordination avec les structures de santé de l'Etat et leurs agents locaux, le programme, qui emploie six personnes, est dévolu au dépistage des malades et à l'octroi du traitement MDT (Multi Drug Therapy). Il s'accompagne de campagnes de diffusion et de sensibilisation de la population.

Ce programme offre un appui important aux prestations étatiques en améliorant significativement la qualité des activités de dépistage, de suivi des patients (dans toutes les conditions médicales spécifiques à la lèpre) et de celles visant à la prévention des invalidités.  Chaque année les consultations effectuées auprès d’environ 1 000 personnes permettent de diagnostiquer une centaine de nouveaux cas de lèpre.